Prof. Dr. Ni Made Pujani lahir di Desa Bungaya, Karangasem, 4 november 1963. Dari pasangan Made Berata dan Ni Ketut Ranis yang keduanya berprofesi sebagai guru SD di desanya. Ia adalah anak kedua dari delapan bersaudara. Kakak dan adiknya ada yang bekerja sebagai Pegawai Negeri Sipil (PNS) di instansi pemerintahan, sebagai guru, sebagai dosen, dan pegawai swasta.
Ia menikah tahun 1991 dengan Drs. I Made Danu Budhiarta, M.Pd yang juga sebagai dosen di Fakultas Olahraga dan Kesehatan Undiksha. Dari pernikahannya ini dikarunia dua anak, yaitu Putu Hari Sudewa, M.Pd. sebagai dosendi Prodi S1 Pendidikan IPA Undiksha dan Made Tantri Pratiwi, S.Pd. yang bekerja di dunia pariwisata.
Ni Made Pujani menempuh pendidikan dari SD, di SDN 2 Bungaya tahun 1969 -1975. Pendidikan SMP di SMP N 1 Amlapura tahun 1976-1979, dan SMA N 1 Karangasem tahun 1980-1982.
Lahir di lingkungan pendidik mendorongnya untuk melanjutkan ke Pendidikan Tinggi. Ia kuliah di program S1 Pendidikan Fisika FKIP UNUD tahun 1982-1987.
Setelah menikah, bersama sang suami tetap membantu keluarga sembari melanjutkan studi S2 tahun 1994-1997 di Institut Teknologi Bandung dengan mengambil bidang Fisika, kelompok minat bakat fisika bumi. Sepuluh tahun kemudian ia melanjutkan studi S3 di Prodi Pendidikan IPA UPI Bandung mulai 2007 dan selesai tahun 2011. Ia mengambil bidang pendidikan IPA konsentrasi Fisika.
Kuliah S2 dan S3-nya berjalan lancar dan dibantu dengan beasiswa BPPS. Tantangannya adalah jarak tempat kuliah yang jauh dan msh sulit berkomunikasi. Tetapi dengan komitmen yang kuat, perjalanannya itu dapat dilalui dengan baik dan lancar. (hms)