Tahun akademik 2013/2014 Undiksha kembali memperoleh kewenangan untuk mengelola jurusan baru, yakni Jurusan D-3 Desain Komunikasi Visual yang berada di lingkungan Fakultas Bahasa dan Seni berdasarkan Surat Penugasan Penyelenggaraan Ditjen Dikti Nomor 292/E.E2/DT/2013 tanggal 5 April 2013, Jurusan D-3 Perpustakaan, Jurusan D-3 Survey dan Pemetaan yang berada di lingkungan Fakultas Ilmu Sosial berdasarkan Surat Penugasan Penyelenggaraan Ditjen Dikti Nomor 618/E.E2/DT/2013 tanggal 5 Juli 2013, dan jurusan Pendidikan Sosiologi (S1) yang berada di lingkungan Fakultas Imu Sosial berdasarkan Surat Penugasan Penyelenggaraan Ditjen Dikti Nomor 667/E.E2/DT/2013 tanggal 18 Juli 2013.  Seiring dengan terbitnya Peraturan Menteri Riset, Teknologi, dan Pendidikan Tinggi Republik Indonesia Nomor 14 Tahun 2016 tentang Organisasi dan Tata Kerja Universitas Pendidikan Ganesha, maka    fakultas, jurusan, dan program studi yang ada di lingkungan Undiksha adalah sebagai berikut.

1. Fakultas Matematika dan llmu Pengetahuan Alam (FMIPA) membawahi:
   1. Program Studi Pendidikan Matematika (S1)
   2. Program Studi Pendidikan Fisika (S1)
   3. Program Studi Pendidikan Kimia (S1)
   4. Program Studi Pendidikan Biologi (S1)
   5. Program Studi Analis Kimia (D-III)
   6. Program Studi Budidaya Kelautan (D-III)
   7. Program Studi Pendidikan IPA
   8. Program Studi Kimia (S1)
   9. Program Studi Matematika (S1)
   10. Program Studi Biologi (S1)
   11. Program Studi Akuakultur (S1)
   12. Program Studi Pendidikan IPA (S2)
   13. Program Studi Pendidikan Matematika (S2)
2. Fakultas Hukum dan llmu Sosial (FHIS) membawahi:
   1. Program Studi Pendidikan Sejarah (S1)
   2. Program Studi Pendidikan Geografi (S1)
   3. Program Studi Pendidikan Pancasila dan Kewarganegaraan (S1)
   4. Program Studi Perpustakaan (D-III)
   5. Program Studi Survey dan Pemetaan (D-III)
   6. Pendidikan Sosiologi (S1)
   7. Program Studi Ilmu Hukum
3. Fakultas Bahasa dan Seni (FBS) membawahi:
   1. Program Studi Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia (S1)
   2. Program Studi Pendidikan Bahasa Inggris (S1)
   3. Program Studi Pendidikan Seni Rupa (S1)
   4. Program Studi Bahasa Inggris (D-III)
   5. Program Studi Pendidikan Bahasa Bali (S1)
   6. Program Studi Pendidikan Bahasa Jepang (S1)
   7. Program Studi Desain Komunikasi Visual (D-III)
4. Fakultas Ilmu Pendidikan (FIP) membawahi:
   1. Program Studi Bimbingan dan Konseling (S1)
   2. Program Studi Teknologi Pendidikan (S1)
   3. Program Studi Pendidikan Guru Sekolah Dasar disingkat PGSD (S1)
   4. Program Studi Pendidikan Guru Pendidikan Anak Usia Dini disingkat PG PAUD (S1)
5. Fakultas Teknik dan Kejuruan (FTK) membawahi:
   1. Program Studi Pendidikan Kesejahteraan Keluarga (S1)
   2. Program Studi Manajemen Informatika (D-III)
   3. Program Studi Teknik Elektronika (D-III)
   4. Program Studi Pendidikan Teknik Informatika (S1)
   5. Program Studi Pendidikan Teknik Elektro (S1)
   6. Program Studi Pendidikan Teknik Mesin (S1)
6. Fakultas Olahraga dan Kesehatan (FOK) membawahi:
   1. Program Studi Pendidikan Jasmani, Kesehatan, dan Rekreasi (S1)
   2. Program Studi Ilmu Keolahragaan (S1)
   3. Program Studi Pelatihan Olahraga Pariwisata (D-III)
   4. Program Studi Pendidikan Kepelatihan Olahraga (S1)
7. Fakultas Ekonomi (FE) membawahi:
   1. Program Studi Pendidikan Ekonomi (S1)
   2. Program Studi Akuntasi (D-III
   3. Program Studi Perhotelan (D-III)
   4. Program Studi Manajemen (S1)
   5. Program Studi Akuntansi (S1)
8. Program Pascasarjana yang membawahi:
   1. Program Studi Pendidikan Bahasa (S2)
   2. Program Studi Penelitian dan Evaluasi Pendidikan (S2)
   3. Program Studi Administrasi Pendidikan (S2)
   4. Program Studi Pendidikan Dasar (S2)
   5. Program Studi Teknologi Pembelajaran (S2)
   6. Program Studi Pendidikan Bahasa Inggris (S2)
   7. Program Studi Bimbingan dan Konseling (S2)
   8. Program Studi Pendidikan IPS (S2)
   9. Program Studi Ilmu Komputer (S2)Program Studi Ilmu Pendidikan (S3)
   10. Program Studi Pendidikan Bahasa (S3)
   11. Program Studi Pendidikan Dasar (S3)